Questões para quarta feira (7/10)

Você resolveu submeter um projeto para FAPESP e, assim sendo, arrumou as malas e saiu viajando pelo Brasil para achar um sistema ecológico interessante para ser investigado no seu projeto. Tomando como base a sua escolha responda as perguntas que se seguem:

(1) Descrever o sistema ecológico escolhido e justificar sua escolha.

(2) Que tipo de microrganismos você esperaria encontrar no ambiente escolhido? (exemplos: autotróficos/heterotróficos, halotolerantes, termofílicos, etc...)

(3) Como você investigaria as características adaptativas de um microrganismo presente neste ambiente?

Aula Engenharia Genética de Microrganismos

Pessoal, o link para a aula de Eng. Genética.

Aula Microrganismos Patogênicos

Pessoal, a aula de Microrganismos Patogênicos!

Pessoal, estou colocando a minha aula em ppt no google docs.
Em breve disponibilizarei as referências.

Aula:Ecologia Microbiana

Aula Bioinformática

Oi Pessoal! Segue a bibliografia suporte para a aula de bioinformática do Prof. Renato.

1: Koide T, Pang WL, Baliga NS. The role of predictive modelling in rationally
re-engineering biological systems. Nat Rev Microbiol. 2009 Apr;7(4):297-305. Epub
2009 Mar 2. PubMed PMID: 19252506.

2: Chen Z, Lewis KA, Shultzaberger RK, Lyakhov IG, Zheng M, Doan B, Storz G,
Schneider TD. Discovery of Fur binding site clusters in Escherichia coli by
information theory models. Nucleic Acids Res. 2007;35(20):6762-77. Epub 2007 Oct
5. PubMed PMID: 17921503; PubMed Central PMCID: PMC2189734.

3: Fuhrman JA. Microbial community structure and its functional implications.
Nature. 2009 May 14;459(7244):193-9. Review. PubMed PMID: 19444205.

4: Rusch DB, Halpern AL, Sutton G, Heidelberg KB, Williamson S, Yooseph S, Wu D,
Eisen JA, Hoffman JM, Remington K, Beeson K, Tran B, Smith H, Baden-Tillson H,
Stewart C, Thorpe J, Freeman J, Andrews-Pfannkoch C, Venter JE, Li K, Kravitz S,
Heidelberg JF, Utterback T, Rogers YH, Falcón LI, Souza V, Bonilla-Rosso G,
Eguiarte LE, Karl DM, Sathyendranath S, Platt T, Bermingham E, Gallardo V,
Tamayo-Castillo G, Ferrari MR, Strausberg RL, Nealson K, Friedman R, Frazier M,
Venter JC. The Sorcerer II Global Ocean Sampling expedition: northwest Atlantic
through eastern tropical Pacific. PLoS Biol. 2007 Mar;5(3):e77. PubMed PMID:
17355176; PubMed Central PMCID: PMC1821060.

5: Raes J, Bork P. Molecular eco-systems biology: towards an understanding of
community function. Nat Rev Microbiol. 2008 Sep;6(9):693-9. PubMed PMID:
18587409.

6: Medini D, Serruto D, Parkhill J, Relman DA, Donati C, Moxon R, Falkow S,
Rappuoli R. Microbiology in the post-genomic era. Nat Rev Microbiol. 2008
Jun;6(6):419-30. Epub 2008 May 13. Review. PubMed PMID: 18475305.

7: Cases I, de Lorenzo V. Promoters in the environment: transcriptional
regulation in its natural context. Nat Rev Microbiol. 2005 Feb;3(2):105-18.
Review. PubMed PMID: 15685222.

8: Link para aula em ppt.

Aula do dia 26/08

Haverá uma alteração no programa de aulas que vocês receberam !
Na próxima semana, dia 26/08, a aula será Ecologia Microbiana, proferida pela Camila. No final haverá o tempo de discussão com os grupos sobre os projetos que serão desenvolvidos ao longo do curso!

Projetos

Para esclerecer a questão dos projetos:
- preparem uma idéia para discutirmos no final da próxima aula (cerca de 10 minutos para cada grupo) ;
- os projetos serão desenvolvidos ao longo da disciplina - teremos um espaço de discussão dos projetos em todas as aulas;

Vocês podem postar suas dúvidas nos "comentários" aqui do blog.